O Parque Nacional e Reserva Marinha de Watamu é um local crítico para a reprodução de várias espécies criticamente em perigo e quase ameaçadas. A Rocha Quénia realiza levantamentos e destacamentos de Estações de Vídeo Subaquáticas Remotas Baiadas (BRUVS) ao longo da encosta do recife para monitorizar os habitats e populações de tubarões.
A Rocha tem sido financiada neste trabalho pelo Shark Conservation Fund, um fundo filantrópico colaborativo de partilha de conhecimentos e recursos para enfrentar as ameaças que os tubarões e as raias do mundo enfrentam. O Fundo de Conservação de Tubarões é um projeto da Rockefeller Philanthropy Advisory.
Tubarões de recife de ponta branca: na sua maioria noturnos, a equipa encontrou-os a descansar debaixo das rochas e fendas durante os mergulhos.
Tubarões de recife de ponta preta: muito comuns nesta área. Grandes agregações são frequentemente avistadas ao longo da zona interdita. Estão quase ameaçados, pelo que a equipa fica de olho neles. Os mais novos são normalmente vistos muito perto da costa e são frequentemente tímidos e fogem quando alguém se aproxima.
Raias Elétricas Marmoradas: também conhecidas como “raias torpedo marmoreadas” porque deixam literalmente as suas presas em estado de choque. A sua cor de pele mosqueada torna-o quase invisível, mas está equipado com órgãos elétricos na base das barbatanas peitorais que geram uma forte descarga elétrica.
Raia favo de mel: Estas belas criaturas têm até 2 metros de comprimento, e estão listadas como vulneráveis na lista vermelha da UICN.
Peixe-Guitarra Halavi: esta espécie gravemente ameaçada tem sido vista frequentemente nos fundos arenosos e nos fundos de erva marinha da WMNP.
Raias de Águia Pintadas: geralmente encontradas nos recifes de coral, alimentando-se de uma variedade de invertebrados.
Tubarões-baleia: vulgarmente vistos desde os meses de Dezembro até Fevereiro, quando há pequenos crustáceos e fitoplâncton suficientes.